امام خميني سيزده سال در اين مسجد تدريس داشتند
مسجد شيخ انصاري در محله "حُوَيش" در شهر نجف اشرف با مساعدت و تحت نظارت شيخ مرتضي انصاري (ره) احداث گرديد .
اين مسجد محل برگزاري جلسات درس بزرگان حوزه علميه نجف اشرف از جمله سيّد محمّد كاظم يزدي ، و امام خميني (ره) در سال هاي تبعيد و اقامت در نجف بوده است ، در اين مسجد به اقامه نماز جماعت و تدريس ميپرداخت.
امام خميني قريب سيزده سال در دوران تبعيد در عراق به تدريس در حوزه علميه نجف در مسجد شيخ انصارى پرداخته و معارف اهل بيت و فقه را در عاليترين سطوح تدريس مي كردند.
امام خميني (ره) سلسله درس هاى خارج فقه خويش را با همه مخالفتها و كارشكني هاى عناصر مغرض در آبان ۱۳۴۴ دراين مسجد آغاز كردند و تدريس هاي ايشان تا زمان هجرت از عراق به پاريس ادامه داشت.
مبانى متقن امام در فقه و اصول و تسلط ايشان در رشته هاى معارف اسلامى بدان پايه بود كه پس از اندك زمانى على رغم كارشكني هاى مختلف ، حوزۀ درسى ايشان به عنوان يكى ازبرجسته ترين حوزه هاى درسى نجف از لحاظ كيفيت و كميت شاگردان شناخته شد.
جمع زيادى از طلاب علوم ديني اعم از ايرانى ، پاكستانى ، عراقى ، افغانى ، هندى و كشورهاى حوزۀ خليج فارس همه روزه از محضر درسى ايشان بهره مى بردند.
در اين مسجد بود كه امام خميني (ره) براى نخستين بار مبانى نظرى ولايت فقيه را در چندين جلسه تدريس نمودند.
حضرت امام خميني (ره) كتاب ولايت فقيه را به زبان فارسي براي طلاب ارائه ميدادند و حتي بزرگاني از علما مانند آيت الله شهيد محمدباقر صدر براي تأييد و تقويت امام ، شاگردان خود را پاي درس ايشان ميفرستادند .
مسجد شيخ انصاري همچنان پایگاهی برای فراگیری علوم دینی است و يكي از مدارسي را تشكيل ميدهد كه در حال حاضر بيشتر در آن دروس مقدمات، سطح 1 و 2 و خارج تدريس ميشود.
مسجد شيخ انصاري وقف بوده و توليت آن را آيت الله سيد رضي الدين مرعشي كه يكي از علماي معروف نجف و استاد درس خارج فقه و اصول حوزه نجف مي باشند بعهده دارند .